El mensaje viene mostrado no por el propio Codeception, sino por "phpunit-bridge", así que simplemente, eliminando este paquete, se eliminan estos mensajes ;)

Otro de los módulos que tal vez necesitemos instalar en el servidor ubuntu que acabamos de montar es el intl.
Su instalación, como la de tantos otros, es muy sencilla, simplemente ejecutando el comando:
aptitude install php5-intl
y como siempre reiniciamos el servicio
service apache2 restart
Si el problema lo has encontrado a la hora de instalar moodle, deberás instalar también el módulo xrmp
Puede que también te interese saber cómo se instalan los siguientes módulos:
Curl PHP
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