El mensaje viene mostrado no por el propio Codeception, sino por "phpunit-bridge", así que simplemente, eliminando este paquete, se eliminan estos mensajes ;)
Este es un problema que me ha ocurrido recientemente y es que, desde el XAMPP Manager, al intentar iniciar el servicio Mysql, siempre se paraba. Podemos intentar iniciar el servicio desde el terminal con el siguiente comando: $sudo /Applications/XAMPP/xamppfiles/bin/mysql.server start